Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms