Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NRXN3Q9Y4C0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NRXN3Q9Y4C0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms