Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF8Q9UPP1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF8Q9UPP1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms