Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
INO80Q9ULG1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
INO80Q9ULG1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms