Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MLH3Q9UHC1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MLH3Q9UHC1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms