Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ARHGEF12Q9NZN5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARHGEF12Q9NZN5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms