Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TOPORSQ9NS56 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms