Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 COA4-201ENST00000355693 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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