Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC113Q9H0I3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms