Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAPERQ9BY12 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAPERQ9BY12 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms