Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SCAF11Q99590 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SCAF11Q99590 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms