Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNGAP1Q96PV0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGAP1Q96PV0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms