Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EP400Q96L91 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EP400Q96L91 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms