Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF9

CDCA5, Sororin, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA5Q96FF9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA5Q96FF9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA5Q96FF9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms