Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC10A4Q96EP9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC10A4Q96EP9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms