Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FBXO17Q96EF6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FBXO17Q96EF6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FBXO17Q96EF6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FBXO17Q96EF6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FBXO17Q96EF6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FBXO17Q96EF6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FBXO17Q96EF6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FBXO17Q96EF6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms