Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRUQ92729 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPRUQ92729 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms