Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROM2Q8N271 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROM2Q8N271 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms