Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZA3

H1FOO, Histone H1oo, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1FOOQ8IZA3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1FOOQ8IZA3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1FOOQ8IZA3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms