Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vwc2Q8C8N3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vwc2Q8C8N3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms