Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ECM29Q5VYK3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM29Q5VYK3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms