Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GPAT3Q53EU6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GPAT3Q53EU6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms