Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP13-4Q3LI77 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms