Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NPTX1Q15818 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms