Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRIM25Q14258 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM25Q14258 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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