Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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UBE4AQ14139 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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UBE4AQ14139 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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UBE4AQ14139 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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UBE4AQ14139 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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UBE4AQ14139 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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UBE4AQ14139 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE4AQ14139 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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