Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B2Q13435 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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