Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP140Q13342 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP140Q13342 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP140Q13342 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP140Q13342 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP140Q13342 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP140Q13342 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SP140Q13342 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SP140Q13342 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SP140Q13342 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SP140Q13342 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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