Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIGQ13278 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RIGQ13278 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RIGQ13278 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms