Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SRSF5Q13243 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SRSF5Q13243 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms