Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACACAQ13085 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms