Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
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GRIK3Q13003 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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GRIK3Q13003 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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GRIK3Q13003 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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GRIK3Q13003 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK3Q13003 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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