Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GOLGA3Q08378 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GOLGA3Q08378 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms