Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKCDQ05655 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms