Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP7AQ04656 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP7AQ04656 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms