Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPCQ03188 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CENPCQ03188 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms