Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IRX3P78415 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IRX3P78415 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IRX3P78415 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IRX3P78415 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms