Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACLYP53396 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACLYP53396 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACLYP53396 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACLYP53396 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACLYP53396 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACLYP53396 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACLYP53396 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACLYP53396 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACLYP53396 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACLYP53396 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACLYP53396 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACLYP53396 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACLYP53396 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACLYP53396 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms