Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.18
SMARCA4P51532 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
SMARCA4P51532 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms