Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VEGFBP49765 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VEGFBP49765 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms