Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5AP29375 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5AP29375 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms