Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPRMP28827 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRMP28827 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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