Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB2P26583 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms