Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRBP23467 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRBP23467 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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