Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA6P23229 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA6P23229 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms