Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MCF2P10911 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCF2P10911 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCF2P10911 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCF2P10911 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCF2P10911 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCF2P10911 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCF2P10911 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCF2P10911 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MCF2P10911 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MCF2P10911 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCF2P10911 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCF2P10911 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCF2P10911 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MCF2P10911 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms