Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SAA2P0DJI9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SAA2P0DJI9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms