Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NEFMP07197 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NEFMP07197 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NEFMP07197 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NEFMP07197 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFMP07197 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFMP07197 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFMP07197 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFMP07197 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NEFMP07197 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NEFMP07197 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms