Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDM4AO75164 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDM4AO75164 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms