Protein–RNA interactions for Protein: O60658

PDE8A, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8AO60658 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE8AO60658 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE8AO60658 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms